Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms