Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ercc8Q8CFD5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ercc8Q8CFD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ercc8Q8CFD5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ercc8Q8CFD5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ercc8Q8CFD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ercc8Q8CFD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc8Q8CFD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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