Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI6

Ccdc158, Coiled-coil domain-containing protein 158, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc158Q8CDI6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms