Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg16l1Q8C0J2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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