Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp47Q8BY87 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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Usp47Q8BY87 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
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Usp47Q8BY87 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp47Q8BY87 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
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Usp47Q8BY87 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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Usp47Q8BY87 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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Usp47Q8BY87 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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Usp47Q8BY87 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
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Usp47Q8BY87 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp47Q8BY87 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms