Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan12Q8BKT6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan12Q8BKT6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms