Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srgap3Q812A2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srgap3Q812A2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srgap3Q812A2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms