Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms