Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Scn4bQ7M729 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Scn4bQ7M729 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scn4bQ7M729 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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