Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms