Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC061212Q6P8K3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms