Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1Q6NXH3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpbp1Q6NXH3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms