Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja3Q64448 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gja3Q64448 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja3Q64448 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms