Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3a2Q62203 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms