Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3Q60803 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf3Q60803 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf3Q60803 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms