Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CttnQ60598 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CttnQ60598 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CttnQ60598 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CttnQ60598 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms