Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmtc2Q56A06 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmtc2Q56A06 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmtc2Q56A06 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms