Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc43Q3V0L5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc43Q3V0L5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc43Q3V0L5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
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