Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc4Q3UP44 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms