Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd27Q3UMR0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd27Q3UMR0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms