Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp19Q3UJD6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp19Q3UJD6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms