Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms