Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm2Q3TWN3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms