Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFIL3Q16649 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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