Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA1Q15788 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
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NCOA1Q15788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
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NCOA1Q15788 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
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NCOA1Q15788 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
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NCOA1Q15788 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NCOA1Q15788 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
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