Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT31Q15323 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms