Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIDRQ14159 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIDRQ14159 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIDRQ14159 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIDRQ14159 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIDRQ14159 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIDRQ14159 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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SPIDRQ14159 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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SPIDRQ14159 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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SPIDRQ14159 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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SPIDRQ14159 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIDRQ14159 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIDRQ14159 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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SPIDRQ14159 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIDRQ14159 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIDRQ14159 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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