Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP140Q13342 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP140Q13342 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP140Q13342 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP140Q13342 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP140Q13342 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP140Q13342 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP140Q13342 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SP140Q13342 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP140Q13342 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SP140Q13342 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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SP140Q13342 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP140Q13342 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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SP140Q13342 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SP140Q13342 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP140Q13342 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP140Q13342 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP140Q13342 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SP140Q13342 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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SP140Q13342 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP140Q13342 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP140Q13342 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP140Q13342 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SP140Q13342 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SP140Q13342 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SP140Q13342 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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