Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKP2Q13309 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms