Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r2Q0VGB7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r2Q0VGB7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms