Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSRP1Q08945 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSRP1Q08945 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms