Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Padi2Q08642 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Padi2Q08642 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms