Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff1Q08423 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff1Q08423 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms