Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp2Q06649 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms