Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdk18Q04899 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms