Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms