Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf1P81269 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atf1P81269 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atf1P81269 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms