Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad50P70388 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms