Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVPABLB-1P60509 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVPABLB-1P60509 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms