Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctdsp1P58466 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdsp1P58466 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ctdsp1P58466 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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