Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms