Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab8aP55258 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab8aP55258 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab8aP55258 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab8aP55258 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab8aP55258 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab8aP55258 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms