Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GemP55041 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GemP55041 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GemP55041 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GemP55041 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GemP55041 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GemP55041 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GemP55041 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms