Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB4P54760 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB4P54760 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms