Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms