Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cav1P49817 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cav1P49817 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cav1P49817 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cav1P49817 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cav1P49817 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms