Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RpiaP47968 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpiaP47968 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms