Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms