Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tac1P41539 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms