Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptk2P34152 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms